Recientemente me encontré con el problema de ocultar las subcategoría en el sidebar de wordpress ya que las opciones que tiene wp_list_categories() no lo permiten. Lo único que puedes hacer es mostrar las subcategorias de una forma mas ordenada con una ligera sangria.

Tienes dos opciones, o usar algún plugin para intentar ocultarlas o simplemente añades al CSS esta línea de código:

.children {display:none}

Con esta regla ocultaremos las subcategorías. Recordad que la opción hierarchical tiene que estar activada, igual a 1.